Daar is baie soorte transmembraanpeptiede, en hul klassifikasie is gebaseer op fisiese en chemiese eienskappe, bronne, inname -meganismes en biomediese toepassings. Volgens hul fisiese en chemiese eienskappe kan membraan deurdringende peptiede in drie soorte verdeel word: kationies, amfifilies en hidrofobies. Kationiese en amfifiliese membraan deurdringende peptiede is 85%, terwyl die deurdringende peptiede van hidrofobiese membraan slegs 15%uitmaak.
1. kationiese membraan deurdringende peptied
Kationiese transmembraanpeptiede bestaan uit kort peptiede wat ryk is aan arginien, lysien en histidien, soos tat, penetratien, polyarginine, p22n, dpv3 en dpv6. Onder hulle bevat arginien guanidien, wat waterstofbinding met negatief gelaaide fosforsuurgroepe op die selmembraan kan en transmembraanpeptiede in die membraan bemiddel onder die toestand van fisiologiese pH -waarde. Studies van oligarginien (van 3 R tot 12 R) het getoon dat die membraanindringingsvermoë slegs bereik is toe die hoeveelheid arginien so laag as 8 was, en die membraanindringingsvermoë geleidelik toegeneem het met die toename in die hoeveelheid arginien. Lysien, hoewel kationies soos arginien, bevat nie guanidien nie, so as dit alleen bestaan, is die membraanindringingsdoeltreffendheid daarvan nie baie hoog nie. Futaki et al. (2001) het gevind dat goeie membraanindringingseffek slegs bereik kon word as die kationiese selmembraan deurdringende peptied ten minste 8 positief gelaaide aminosure bevat. Alhoewel positief gelaaide aminosuurreste noodsaaklik is vir penetratiewe peptiede om die membraan binne te dring, is ander aminosure ewe belangrik, soos wanneer W14 in F muteer, is die penetratien van penetratien verlore.
'N Spesiale klas kationiese transmembraanpeptiede is kernlokaliseringsreekse (NLSS), wat bestaan uit kort peptiede wat ryk is aan arginien, lysien en prolien en na die kern deur die kernpore -kompleks vervoer kan word. NLS's kan verder verdeel word in enkel- en dubbele tik, bestaande uit onderskeidelik een en twee groepe basiese aminosure. Byvoorbeeld, PKKKRKV van Simian Virus 40 (SV40) is 'n enkele tik -NLS, terwyl kernproteïen 'n dubbele tik -NLS is. KRPAATKKAGQAKKKL is die kort volgorde wat 'n rol in membraantransmembraan kan speel. Aangesien die meeste NLS's ladingsgetalle minder as 8 het, is NLS's nie effektiewe transmembraanpeptiede nie, maar dit kan effektiewe transmembraanpeptiede wees as dit kovalent gekoppel is aan hidrofobiese peptiedvolgordes om amfifiele transmembraanpeptiede te vorm.
2. Amfifiele transmembraanpeptied
Amfifiele transmembraanpeptiede bestaan uit hidrofiliese en hidrofobiese domeine, wat verdeel kan word in primêre amfifiele, sekondêre α-heliese amfifiele, ß-vouende amfifiele en prolien-verrykte amfifiele.
Primêre tipe amfifiele slytasie -membraanpeptiede in twee kategorieë, kategorie met NLSS wat kovalent gekoppel is deur hidrofobiese peptiedvolgorde, soos MPG (GlaflgflgAagstmgawsqpkkkrkv) en PEP - 1 (KetwWetwWWTewSQPKKRKV), albei is gebaseer op die kern van die LocaLealization Sign Signal PKKKKRKV van SV40, waarin die hidrofobiese domein van MPG verband hou met die fusievolgorde van MIV-glikoproteïen 41 (Galflgflgaagstmg A), en die hidrofobiese domein van PEP-1 hou verband met die tryptofaan-ryk cluster met 'n hoë membraanaffiniteit (KetwWet WWTEW). Die hidrofobiese domeine van beide hou egter verband met die PKKKRKV van die kern lokalisering deur WSQP. 'N Ander klas primêre amfifiele transmembraanpeptiede is van natuurlike proteïene, soos PVEC, ARF (1-22) en BPRPR (1-28), geïsoleer.
Die sekondêre α-heliese amfifiliese transmembraanpeptiede bind aan die membraan via α-helices, en hul hidrofiliese en hidrofobiese aminosuurresidue is op verskillende oppervlaktes van die spiraalvormige struktuur, soos MAP (Klalklalk AlkaiKla) geleë. Vir beta -peptiedvou -tipe amfifiliese dra -membraan, is die vermoë om 'n beta -geplooide vel te vorm van kardinale belang vir die penetrasievermoë van die membraan, soos in VT5 (dpkgdpkgvtvtvtvtvtgkgdpkpd) in die proses van die ondersoek van die membraan, gebruik die AM -AM -suurmutasie -analering. Gevoude stuk, die penetrasievermoë van die membraan is baie swak. In prolienverrykte amfifiele transmembraanpeptiede word polyproline II (PPII) maklik in suiwer water gevorm wanneer prolien baie verryk is in die polipeptiedstruktuur. PPII is 'n linkshandige heliks met 3.0 aminosuurreste per beurt, in teenstelling met die standaard regshandige alfa-heliksstruktuur met 3,6 aminosuurreste per beurt. Prolien-verrykte amfifiele transmembraanpeptiede het bees-antimikrobiese peptied 7 (BAC7), sintetiese polipeptied (PPR) N (N) 3, 4, 5 en 6), ens.
3. Hidrofobiese membraan deurdringende peptied
Hidrofobiese transmembraanpeptiede bevat slegs nie-polêre aminosuurreste, met 'n netto lading minder as 20% van die totale lading van die aminosuurvolgorde, of bevat hidrofobiese groepe of chemiese groepe wat noodsaaklik is vir transmembraan. Alhoewel hierdie sellulêre transmembraanpeptiede dikwels misgekyk word, bestaan dit wel, soos fibroblast-groeifaktor (K-FGF) en fibroblast-groeifaktor 12 (F-GF12) van Kaposi se sarkoom.
Postyd: 2025-07-01