Sel-deurdringende peptiede is klein peptiede wat maklik die selmembraan kan binnedring. Hierdie klas molekules, veral CPP's met teikenfunksies, hou 'n belofte vir doeltreffende medisyne -aflewering aan teikenselle.
Daarom het die navorsing daaroor 'n sekere biomediese belang. In hierdie studie is CPP's met verskillende transmembraanaktiwiteite op volgorde -vlak bestudeer en probeer om uit te vind wat die faktore wat die transmembraanaktiwiteit van CPP's beïnvloed, die volgorde -verskille tussen CPP's met verskillende aktiwiteite en nie -CPP's, en 'n metode bekendstel vir die ontleding van biologiese reekse.
CPP's en NonCPPS -reekse is verkry uit die CPPSite -databasis en verskillende letterkundes, en transmembraanpeptiede (HCPP's, MCPP's, LCPP's) met hoë, medium en lae transmembraanaktiwiteit is uit die CPPS -reekse onttrek om datastelle te konstrueer. Op grond van hierdie datastelle is die volgende studies uitgevoer:
1, die aminosuur en sekondêre struktuur samestelling van verskillende aktiewe CPP's en nie -CPP's is deur ANOVA geanaliseer. Daar is gevind dat die elektrostatiese en hidrofobiese interaksies van aminosure 'n belangrike rol gespeel het in die transmembraanaktiwiteit van CPP's, en die spiraalvormige struktuur en ewekansige verbouing het ook die transmembraanaktiwiteit van CPP's beïnvloed.
2. Die fisiese en chemiese eienskappe en lengtes van CPP's met verskillende aktiwiteite is op die tweedimensionele vlak vertoon. Daar is gevind dat CPP's en nie -CPP's met verskillende aktiwiteite onder sommige spesiale eienskappe saamgevoeg kon word, en HCPP's, MCPP's, LCPP's en NONCPP's is in drie groepe verdeel, wat hul verskille toon;
3. In hierdie artikel word die konsep van fisiese en chemiese sentroïed van biologiese volgorde bekendgestel, en die residue wat die volgorde saamstel, word as deeltjiepunte beskou, en die volgorde word onttrek as 'n deeltjie -stelsel vir navorsing. Hierdie metode is op die ontleding van CPP's toegepas deur CPP's met verskillende aktiwiteite op die 3D -vlak volgens PCA -metode te projekteer, en daar is gevind dat die meeste CPP's saamgevoeg is en dat sommige LCPP's saam met nie -CPP's gegroepeer is.
Hierdie studie het implikasies vir die ontwerp van CPP's en die begrip van die verskille in die reekse van CPP's met verskillende aktiwiteite. Daarbenewens kan die ontledingsmetode van fisiese en chemiese sentroïed van biologiese rye wat in hierdie artikel bekendgestel is, ook gebruik word vir die ontleding van ander biologiese probleme. Terselfdertyd kan dit gebruik word as insetparameters vir sommige biologiese klassifikasieprobleme en speel 'n rol in patroonherkenning.
Postyd: 2025-07-02